1. Seleccionar el objeto a modificar, en nuestro caso el cubo; hacer clic derecho sobre el mismo.

2. Ir al ícono en forma de llave.
3. Clic en Add modifier.
4. Clic en Boolean.
5. Clic en object (en el gotero) y luego hacer clic en el otro objeto.
6. En Operation elegir Difference.
7. Clic en Apply.
El resultado será el siguiente: